而今已是日薄西山，今非昔比了，对马六甲海峡的控制也大不如前，只是占着澳门进行贸易。

西班牙此时余威还在，占着马尼拉，从事香料，瓷器，丝绸，茶叶等奢侈品的贸易，势力范围遍布南美大陆，像墨西哥等全为其殖民地。

西班牙的驻菲律宾总督独揽行政、司法和军事大权，通过推行赐封制度，笼络土著上层份子，对当地人横征暴敛。

天主教会则占据着大量的肥沃土地，把持着教育文化事业，成为西班牙殖民统治的支柱。

在经济上，殖民者实行闭锁和垄断政策，签订马尼拉--阿卡普尔科贸易协定，使菲律宾成为西班牙-墨西哥殖民地下属的原材料供应市场。

十七-十九世纪荷兰人的东方商业殖民帝国立足于爪哇岛，以巴达维亚城为中心。

鼎盛时期，荷兰东印度公司广阔的商业和贸易垄断权，向西远至波斯、印度和锡兰（今斯里兰卡），向东延伸到马鲁古香料群岛，向北抵达中国和日本。

移居到巴达维亚城的中国人，是城市建设的开拓者，蔗糖种植和制作的生产者，还是中国商品的供应者，当地大米和烧酒的经营者，零售商业和沿海贸易的中间人，对巴城的发展作出重大的贡献。

万历四十七年，野心勃勃的燕·彼德尔斯逊·昆开始担任荷兰东印度公司第三任总督，正是他为荷兰东方商业殖民帝国奠定了牢固的基础。

巴达维亚城正是在他的率领下袭击和驱赶了万丹军队后建立起来的荷兰东印度公司大帝国的总部，是荷兰统治爪哇以至整个东印度群岛殖民地的政治基础。

天启二年五月，荷兰舰队侵占澎湖。

四年二月，巡抚南居益派总兵俞咨皋、守备王梦熊等收复澎湖，擒荷将高文律。